<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Tehran University Medical Journal</title>
<title_fa>مجله دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی تهران</title_fa>
<short_title>Tehran Univ Med J</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://tumj.tums.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1683-1764</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>1735-7322</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.18869/acadpub.tumj</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>000</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>000</journal_id_nlai>
<journal_id_science>000</journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1392</year>
	<month>12</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2014</year>
	<month>3</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>71</volume>
<number>12</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>بررسی وضعیت میکروساتلایتی دو مارکر BAT-26 و BAT-25 با استفاده از دو تکنیک Real Time PCR و HPLC در سرطان کولورکتال</title_fa>
	<title>Microsatellite instability detection using BAT-25 and BAT-26 by Real Time PCR and HPLC in colorectal cancer</title>
	<subject_fa></subject_fa>
	<subject></subject>
	<content_type_fa>مقاله اصیل</content_type_fa>
	<content_type>Original Article</content_type>
	<abstract_fa>زمینه و هدف: سرطان کولورکتال سومین و چهارمین سرطان شایع به‌ترتیب در آقایان و خانم‌ها می‌باشد. یکی از مسیرهای تومورزایی در سرطان کولورکتال، ناپایداری میکروساتلایتی (MSI) می‌باشد. با توجه به درصد بالای سرطان کولورکتال با ویژگی +MSI در ایران نسبت به دیگر مناطق دنیا، غربالگری این نوع سرطان یک امر ضروری می‌باشد. هدف از این مطالعه بررسی و معرفی تکنیک مناسب با حساسیت و ویژگی بالا جهت غربالگری سرطان کولورکتال با ویژگی +MSI می‌باشد.
روش بررسی: در این مطالعه مقطعی، نمونه‌های سرم خون به منظور غربالگری غیرتهاجمی انتخاب و وضعیت میکروساتلایت آن‌ها با نمونه بافت تومور و نرمال مقایسه گردید. با استفاده از دو تکنیک Real Time PCR و HPLC (کروماتوگرافی مایع با کارآیی بالا) و هم‌چنین دو مارکر BAT-26 و BAT-25، وضعیت میکروساتلایتی نمونه‌ها تعیین شد در این قسمت روش مطالعه بیان شده جهت تایید دقت روش Real Time PCR، نمونه‌هایی که به صورت +MSI تشخیص داده شده بودند، با روش مرجع تعیین توالی نوکلئوتیدی نیز مورد بررسی قرار گرفتند.   
یافته‌ها: بر اساس روش مرجع تعیین توالی، تکنیک Real Time PCR حساسیت و ویژگی 100% در تشخیص تومورهای +MSI داشت، در حالی‌که حساسیت و ویژگی HPLC به‌ترتیب 83% و 100% (با مارکر BAT-26) و 50% و 97% (با مارکر BAT-25) بودند.
نتیجه‌گیری: نتایج مطالعه نشان دادند که تکنیک Real Time PCR در تشخیص نمونه +MSI دارای حساسیت و ویژگی برابر با روش مرجع تعیین توالی می‌باشد، در حالی‌که HPLC حساسیت و ویژگی کم‌تری دارد. هم‌چنین سرم خون نمونه خوبی جهت غربالگری تومورهای +MSI نمی‌باشد.
</abstract_fa>
	<abstract>Background: Colorectal Cancer (CRC) is the third common cancer in the world. One of the pathways in colorectal tumor genesis is Microsatellite Instability (MSI+). MSI is detected in about 15% of all colorectal cancers. Colorectal tumors with MSI have dis-tinctive features compared with Microsatellite Stable (MSS) tumors. Due to the high percentage of MSI+ in patients with CRC in Iran, screening of this type of CRC is im-perative. In current study, two markers (BAT-26 and BAT-25) were used to determine an appropriate screening technique with high sensitivity and specificity to diagnose MSI status in patients with CRC.
Methods: Allelic variation in two markers (BAT-26 and BAT-25) was analyzed in tis-sues and sera of 44 normal volunteers and tumor and matched normal mucosal tissues as well as sera of 44 patients with sporadic colorectal cancer by Real Time PCR (Hy-bridization probe) and High-Performance Liquid Chromatography (HPLC) techniques. The sensitivity and specificity of Real Time PCR and HPLC compared with sequencing as gold standard. The data were statistically analyzed using Student’s t-test and 2 or fisher exact test, where applicable with (P&lt;0.05). Receiver-operating-characteristic (ROC) curves were used to evaluate the sensitivity and specificity.
Results: The sensitivity and specificity of BAT-26 with Real Time PCR method (Hy-bridization probe) were 100% in comparison with gold standard method. Whereas the sensitivity and specificity of BAT-26 and BAT-25 with HPLC were 83%, 100% and 50%, 97%, respectively. Neither HPLC nor Real time PCR could detect circulating DNA with MSI property in sera.
Conclusion: The sensitivity and specificity of real time PCR in MSI detection is the same as sequencing method and more than HPLC. BAT-26 marker is more sensitive than BAT-25 and MSI detection with Real time PCR could be considered as an accu-rate method to diagnose MSI in CRC tissues not sera. 
</abstract>
	<keyword_fa>سرطان کولورکتال، ناپایداری میکروساتلایتی، Real Time PCR، HPLC</keyword_fa>
	<keyword>chromatography, colorectal neoplasm, high pressure liquid microsatellite instability, real-time polymerase chain reaction</keyword>
	<start_page>753</start_page>
	<end_page>762</end_page>
	<web_url>http://tumj.tums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-25-5172&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Marjan </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Rismanchi </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مرجان </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>ریسمانچی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Biochemistry, School of Medicine, Shiraz University of Medical Sciences, Shiraz, Iran. Research Committee, Shiraz University of Medical Sciences, Shiraz, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه بیوشیمی، دانشگاه علوم پزشکی شیراز، شیراز، ایران. کمیته تحقیقات، دانشگاه علوم پزشکی شیراز، شیراز، ایران. </affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Pooneh </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mokarram </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>پونه </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>مکرم</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>mokaram2@gmail.com</email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Biochemistry, School of Medicine, Shiraz University of Medical Sciences, Shiraz, Iran. Gastroenterohepatology Research Center, Nemazee Hospital, School of Medicine, Shiraz University of Medical Sciences, Shiraz, Iran. Advanced Biomedical Sciences, Shiraz University of Medical Sci-ences, Shiraz, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه بیوشیمی، دانشگاه علوم پزشکی شیراز، شیراز، ایران. مرکز تحقیقات گوارش و کبد، بیمارستان نمازی، دانشگاه علوم پزشکی شیراز، شیراز، ایران. دانشکده علوم و فن‌آوری‌های نوین، دانشگاه علوم پزشکی شیراز، شیراز، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mahvash </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Alizadeh Naeeni </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مهوش </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>علیزاده نایینی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Gastroenterohepatology Research Center, Nemazee Hospital, School of Medicine, Shiraz University of Medical Sciences, Shiraz, Iran. Department of Internal Medicine, School of Medicine, Shiraz University of Medical Sciences, Tehran, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات گوارش و کبد، بیمارستان نمازی، دانشگاه علوم پزشکی شیراز، شیراز، ایران. گروه داخلی، دانشگاه علوم پزشکی شیراز، شیراز، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mahdi </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Paryan </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مهدی </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>پرییان</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Research and Development De-partment, Production and Research Complex Pasteur Institute, Tehran, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه تحقیق و توسعه، مجتمع تولیدی و تحقیقاتی انستیتور پاستور، تهران، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Zohreh </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Honardar </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>زهره </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>هنردار</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Biochemistry, School of Medicine, Shiraz University of Medical Sciences, Shiraz, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه بیوشیمی، دانشگاه علوم پزشکی شیراز، شیراز، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Soudabeh </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Kavousipour </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سودابه </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>کاووسی‌پور</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Biochemistry, School of Medicine, Shiraz University of Medical Sciences, Shiraz, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه بیوشیمی، دانشگاه علوم پزشکی شیراز، شیراز، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Abbas </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Alipour </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>عباس </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>علی‌پور</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Epidemiology, Medical Faculty, Mazandaran University of Medical Sciences, Mazandaran, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه آمار، دانشگاه علوم پزشکی مازندران، مازندران، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
