شیما کلوانی، سمانه ذوالقدری،
دوره 11، شماره 3 - ( پاییز 99، دوره 11، شمارهی 3 1399 )
چکیده
زمینه و هدف: ویتیلیگو بیماری مزمن پوست و مو است که با ازدستدادن ملانین مشخص میشود و درصورت عدم درمان معمولاً پیشرونده و غیرقابل برگشت است. هدف از مطالعهی حاضر شناسایی ژنهای درگیر در بیماریزایی ویتیلیگو بود.
روش اجرا: یک مجموعهی دادهی بیان mRNA مرتبط با بیماری ویتیلیگو با کد (GSE65127) از پایگاه داده ژنتیک عمومی (GEO) استخراج گردید. ژنهای افتراقی بیانشده توسط نرمافزار R مشخص گردید. سپس شبکهی ژنی با استفاده از سایت STRING ترسیم و دادهها بهنرم افزار CYTOSCAPE جهت تعیین صد ژن برتر منتقل گردید. در پایان با استفاده از نرمافزار GEPHY شبکهی ژنی ترسیم و مسیرهای متابولیکی ده ژن برتر با استفاده از سایت ENRICHR مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت.
یافتهها: در مقایسه با گروه کنترل، ده ژن برتری که با بیان بیشتر بهدست آمدند
عبارتنداز TP53، HNRNPA2، SRSF1، PTEN، CDC42، EGFR، EIF4A1، MYB، HNRNPH1 و SF381 و ده ژن برتر با بیان کمتر نسبت به کنترل عبارتندازCDH2، LEP، KIT، GRIA2، SPP1، NRXN1، RUNX2، PDGFRB، NES و MYH11. مسیرهای متابولیکی مرتبط با ژنهای افزایش بیانیافته شامل Melanogenesis، Renin secretion و Pancreatic secretion و مسیرهای متابولیکی مرتبط با ژنهای کاهش بیانیافته شامل Prostate cancer، Epithelial cell signaling in helicobacter pylori infection و Melanoma هستند.
نتیجهگیری:شناسایی ژنهای افتراقی بیانشده در ویتیلیگو میتواند به درک ما از بیماریزایی آن کمک کند. همچنین از این ژنها میتوان بهعنوان اهداف دارویی برای درمان استفاده کرد.