1389/12/10، جلد ۱۰، شماره ۳، صفحات ۲۲۹-۲۴۰
عنوان فارسی بررسی تأثير جهش‌های نقطه‌ای ژن آنزيم آسيل کوآ- دهيدروژناز زنجير کوتاه (SCAD) بر ساختار آنزيم با مدلسازی
چکیده فارسی مقاله مقدمه: يکی ازاختلالات مربوط به اکسيداسيون اسيدهای چرب در ميتوکندری، کمبود SCAD (اسيل کوآ- دهيدروژناز زنجير کوتاه) است، که ساختار آنزيم آن در اين مطالعه مورد بررسی قرار گرفته است.
روش‌ها: جهش‌های منتخب با استفاده از نرم‌افزار  MOEدر ساختار آنزيم (2VIG.pdb) وارد شده و برهم کنش‌های اسيد آمينه طبيعی و جهش يافته در اين ساختار با يکديگر مقايسه شدند. از سه نرم‌افزارAggrescan ،Tango  و CAMlila برای بررسی پيشگويی تاثير جهش بر ميزان تجمع آنزيم استفاده شد.
يافته‌ها: جهش‌های بررسی شده سه نوع عمده را در بر می‌گرفتند که در ميان آنها، تغيير نوع اسيد آمينه از باردار/قطبی به آليفاتيک/آروماتيک و بالعکس به صورت مشخصی بر ساختار آنزيم تاثير می‌گذارد. در مورد تغيير اسيد آمينه آليفاتيک يا آروماتيک به يک اسيد آمينه ديگر از همين نوع، بررسی اوليه ساختار می تواند دليل تاثير گذاری نامطلوب جهش را روشن کند، ليکن در مقايسه اين نوع جهش‌ها با يکديگر، موفق عمل نمی‌کند. در بين نرم‌افزارهای پيشگويی تمايل به تجمع نيز، در اين مطالعه، CAMlila بهتر عمل می‌کند.
نتيجه‌گيری: بررسی ساختار سه بعدی پروتئين برای يافتن ميزان اهميت جهش در تمايل پروتئين به تغيير ساختار تا حدود زيادی راهگشاست و حتی ابزارهای کاملاً متداول و در دسترس نيز می‌تواند در اين زمينه مورد استفاده باشد. از طرفی، برای بررسی موارد ظريف‌تر، نظير اختلاف تاثير دو جهش نسبتاً مشابه، نياز به استفاده از ابزار پيشرفته‌تر نظير شبيه‌سازی ديناميک مولکولی وجود دارد.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله اسیل کوآ، دهیدروژناز،جهش نقطه‌ای،ساختار پروتئین،تجمع،مدل‌سازی مولکولی
عنوان انگلیسی
چکیده انگلیسی مقاله
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله 5139---5140---5141---
نشانی اینترنتی http://ijdld.tums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-25-116&slc_lang=fa&sid=fa
فایل مقاله فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده General
نوع مقاله منتشر شده Research
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات